В 1999 году, по благословению первого епископа Барнаульского и Алтайского Антония, на высоком холме, расположенном в Ленинском районе города Барнаула, на пересечении улиц П. Гущина и А. Попова, было решено возвести храм во имя апостола Андрея Первозванного. Община верующих была зарегистрирована 16 сентября 1999 года.
В 2000 году началось строительство храма из деревянного бруса. Меньше чем за год были возведены его стены и крыша, произведена минимальная внутренняя отделка. Во время строительства службы совершались в вагончике, стоявшем неподалеку.
С конца 2000 года в жизни прихода начались не самые лучшие времена: сменялись настоятели, уходило время для сплочения и укрепления общины; церковь начала разрушаться.
В марте 2002 года настоятелем храма был назначен священник Евгений Елисеев.
К началу 2010-х годов в храме был проведен ремонт; построен притвор, где позднее разместилась воскресная школа для взрослых; появились основание для будущей колокольни, церковная лавка; произошло увеличение площади алтаря; для совершения исповеди была отведена отдельная комната; открыта библиотека.
г. Барнаул, ул. Попова, 14Б.